Trolejbusy boli z výroby dodané s vonkajšími tlačidlami na otváranie dverí pracujúcimi na princípe kapacitných snímačov, čo spôsobovalo cestujúcim zvyknutým na klasické tlačidlá problémy pri otváraní dverí. V roku 2016 boli v rámci záručnej opravy vymenené tieto tlačidlá za typ používaný na autobusoch SOR, pričom ako prvé ich dostali vozidlá #6003 a 6005. Zároveň im bol skrátený pridlhý výstražný signál pri zatváraní dverí.
V roku 2023 prebehla úprava vozidla #6001 na výcvikové vozidlo. Úprava spočívala v doplnení sedadla pre inštruktora a doplnení prídavného brzdového pedálu.
Od jesene 2025 boli trolejbusom postupne vymieňané pôvodné textilné poťahy sedadiel za koženkové. Ako prvé boli prečalúnené vozidlá #6030, 6109, 6110, 6111.
Ďalšou úpravou bola výmena kamerového systému za novší typ s komponentami od firmy Streamax. Výmenu realizovala firma BUSE Blansko od druhej polovice roka 2025.
Prvé dve vozidlá (#6007 a 6008) z prvej 15 kusovej série boli do Bratislavy dodané 3. apríla 2014. Od 9. apríla 2014 sa na nich v uliciach mesta vykonával zácvik inštruktorov a vodičov.
Vozidlá #6001 - 6015 sa do premávky s cestujúcimi zaradili postupne od 4. júna 2014 na linkách 64, 204, 206, 210, 211 a 212. Na linku 64 sa však vypravovali len krátku dobu. Všetkých 15 trolejbusov bolo pôvodne zaradených do vozovne Trnávka. Od 1. februára 2015 boli z dôvodu prebiehajúcej modernizácie vozovní trolejbusy Škoda 30 Tr garážované vo vozovni Hroboňova, kde údržbu trolejbusov prevzala Škoda Electric, kde nakoniec aj po ukončení modernizácie zostali.
Prvý trolejbus s diesel-elektrickým agregátom #6101 bol dodaný 19. augusta 2014 a do skúšobnej prevádzky s cestujúcimi sa zaradil od 12. novembra 2014, pričom sa skúšal aj na autobusovej linke 32. Ďalšie tieto vozidlá boli dodané v apríli a máji 2015, pričom do premávky sa zaraďovali postupne od 20. mája 2015. Od 1. júna 2015 boli tieto vozidlá vypravované na linku 210, ktorá sa predĺžila o úsek bez trolejového vedenia od Autobusovej stanice k Novému SND. Ich premávka na linke 210 však nebola bezproblémová, len za prvý mesiac premávky zaznamenalo 6 sprevádzkovaných trolejbusov spolu takmer 50 porúch počas prevádzky. Neskôr sa podarilo poruchovosť týchto vozidiel znížiť a využívané boli aj na linke 205 z Rajskej na Trnávku a v menšej miere aj na iných linkách obsluhovaných v tom čase krátkymi trolejbusmi.
Posledných 20 trolejbusov Škoda 30 Tr (#6016 - 6035) bolo do Bratislavy dodaných v auguste a septembri 2015 a zaradené boli do vozovne Trnávka. Do premávky sa zaraďovali postupne od 16. septembra 2015.
Po reorganizácii trolejbusových liniek od 4. júla 2016 boli trolejbusy Škoda 30 TrDG vypravované najmä na linky 64 (Lovinského - Jelačičova, počas voľných dní), 208 (Šulekova - Mliekárenská), 210 (Hlavná stanica - Nové SND) a využívali sa aj na trolejbusovom záložnom vozidle. Jedno vozidlo z linky 210 vykonávalo aj polnočný spoj linky N72 na Dolné hony.
V roku 2018 začali technické problémy trolejbusov Škoda 30 TrDG znova pribúdať a opäť boli v prípade nedostatku prevádzkyschopných vozidiel nahradzované autobusmi. Z rovnakého dôvodu boli od leta 2019 tieto trolejbusy na linke 210 dočasne nahradené autobusmi. V roku 2020 počas pandémie choroby Covid-19 zabezpečovalo vozidlo Škoda 30 TrDG aj prestávky vodičom na linke 33.
Po prečíslovaní trolejbusových liniek na začiatku novembra 2021 boli trolejbusy Škoda 30 Tr nasadzované na linky 44 (ex 203), 45 (ex 211), 49 (ex 209), počas voľných dní aj na linky 47 (ex 207) a 64 (ex 204). Trolejbusy Škoda 30 TrDG boli vypravované na linku 40 (ex 210) a čiastočne aj na linku 60 (ex 205). Z dôvodu úsporných opatrení boli od 13. februára do 9. júla 2023 krátke trolejbusy vo voľných dňoch vypravované aj na linku 72. Po skrátení linky 64 od 5. augusta 2023 boli trolejbusy Škoda 30 Tr nasadené na túto linku celotýždenne. K septembru 2023 sa v špičke pracovného dňa vypravovalo 35 trolejbusov Škoda 30 Tr(DG) na linky 40, 44, 45, 49, 60 a 64 (6+6+2+10+6+5) a 2 trolejbusy 30 TrDG ako záložné vozidlá, vo voľných dňoch bola výprava týchto trolejbusov 26 vozidiel na linky 40, 44, 47, 49, 60 a 64 (4+4+5+4+5+4) a jeden záložný trolejbus, spoje linky 45 zabezpečovali vozidlá z linky 47.
Vypravovanie trolejbusov Škoda 30 TrDG na linku 40 skončilo k 3. februáru 2024, kedy výkony na tejto linke prevzali nové kĺbové trolejbusy Škoda 27 TrA Solaris. Jedno vozidlo 30 TrDG sa naďalej využívalo ako trolejbusové záložné vozidlo, druhé bolo v prípade dostatku prevádzkyschopných vozidiel nahradené kĺbovým trolejbusom Škoda 27 TrA Solaris. Na ďalšie linky boli vypravované podľa aktuálnych prevádzkových potrieb, prevažne však na linku 60.
K 29. marcu 2024 skončilo aj vypravovanie vozidiel Škoda 30 Tr na linku 44, keďže po jej predĺžení cez Drotársku cestu na Hlavnú stanicu na ňu boli nasadené nové trolejbusy SOR TNS 12 s trakčnými batériami. Špičková výprava trolejbusov Škoda 30 Tr(DG) v pracovných dňoch školského roka klesla na 23 vozidiel na linkách 45, 49, 60 a 64.
Od 1. júla 2024 boli trolejbusy Škoda 30 TrDG nasadené na linku 33 na ostrovnej trolejbusovej trati na Dlhé diely, kde nahradili kĺbové vozidlá Škoda 25 Tr Irisbus a Škoda 30 Tr SOR. Zároveň boli vypravované aj na ďalšie linky z vozovne Hroboňova (45, 47, 64), kam boli tieto trolejbusy preradené. Naopak, do vozovne Trnávka boli preradené vozidlá Škoda 30 Tr #6010 - 6015. Podľa prevádzkových potrieb boli niektoré vozidlá z Trnávky požičiavané vozovni Hroboňova. Vybudovanie novej trolejbusovej trate medzi Riviérou a Patrónkou umožnilo od leta 2026 vypravovať na linku 33 aj trolejbusy bez naftového agregátu. Trolejbusy Škoda 30 Tr na ňu boli vypravované iba v júli a auguste 2026, keďže od septembra bola táto linka pokrytá kĺbovými trolejbusmi Škoda 31 Tr. K septembru 2026 bola špičková výprava krátkych trolejbusov v pracovných dňoch na úrovni 22 vozidiel na linkách 45, 49, 60 a 64.
