Niektoré zastávky nebudú dočasne obsluhované.
Pre opravu vodovodu na križovatke Čapajevovej a Björnsonovej dňa 18. februára 2025 od 8:00 do 16:00 zmenená trasa linky 39 medzi zastávkami Trojica a Centrum/VUKOV. Linka pôjde obchádzkou cez ulice Levočská, V. Clementisa a Volgogradská.
Linka 39 nebude obsluhovať zastávky Sabinovská, Björnsonova, Jazdecká a Mukačevská.